بعد مرور عامين ونصف على مغادرة ناروتو قرية كونوها لمرافقة جيرايا في رحلة تدريبية، يعود ليجد نفسه أمام واقع جديد. فقد تفوق عليه جميع زملائه في الرتب، تاركين إياه في مؤخرة الصف. ولكنّ طموح ناروتو لم ينطفئ، فهدفه الأساسي هو إنقاذ صديقه ساسوكي، مهما كلفه ذلك. يواجه ناروتو خلال رحلته الجديدة أعداءً أشدّ ضراوة وخطورة. ومع كشف النقاب عن مخططات المنظمة الإجرامية “أكاتسوكي”، يجد ناروتو نفسه ينزلق تدريجيًا تحت تأثير وحش الكيوبي ذي الذيول التسعة، ممّا يضاعف المخاطر التي تنتظره. هل سينجح ناروتو في تحقيق هدفه وإنقاذ ساسوكي؟